B. Vogler a été nommé en 1976 à la chaire de professeur d'histoire d'Alsace de l'université de Strasbourg, où il a été directeur de l'Institut d'histoire d'Alsace de 1976 à 2003. Il a publié une quinzaine d'ouvrages sur l'histoire de l'Alsace et sur le protestantisme dans le monde germanique à l'époque moderne.